財政部說明，上市、上櫃公司依證券交易法第二十八條之二規定購買之庫藏股票，於轉讓或註銷時之相關課稅規定，業經該部九十二年十二月四日台財稅字第○九二○四五六六○二號令發佈在案。上開核釋係以「上市、上櫃公司依證券交易法第二十八條之二規定購買庫藏股票者」為適用對象，但公司依公司法第一百五十八條、第一百六十七條、第一百六十七條之一、第一百八十六條及第三百十七條規定，也會發生下列購買庫藏股票之情形：
財政部官員表示，上市公司被併購後股票下市，存續公司再對剩餘股東強制合併，是以發「現金」方式收回股權，視為消滅公司分配股利，股東拿到的現金超過其原始出資額的部分，視為營利所得，必須要繳所得稅，最高四○％。
據財部九十三年對「現金併購」解釋令，股東因公司「合併」，自消滅公司獲配之現金，超過出資額部分，按股利所得課稅。意即合併後，被消滅公司股東不再投資，是屬於「營利所得」。
為釐清公司以發行特別股與被收購公司股東進行股份轉換，並約定於特定期間內收回特別股之併購方式所產生之課稅疑義，財政部已明確規定如下：公司之股東依企業併購法第29條規定，以原持有之該公司股票，轉換取得他公司發行之特別股者，各該讓與已發行股份予他公司之股東，其所抵繳他公司發行特別股股款之金額超過其原始取得成本部分，屬證券交易所得；嗣後該發行特別股之公司贖回特別股時，其支付該等特別股股東之金額，超過股份轉換時該等股東以讓與之股份抵繳特別股股款金額之部分，屬股利所得（投資收益），應依規定課徵所得稅。