一、案例問題
有一家開業很久診所，由於甲院長年事已高但是無子繼承又不忍一手經營的診所凋零，所以要將診所頂讓給乙醫生，頂讓金額（權利金含設備500萬元），這樣子是不是要開立發票呢？
二、經濟事實分析
一般診所頂讓，實務上可能以原診所變更負責人或成立新診所繼續執業，而不同之頂讓變更方式，負擔之稅捐義務可能有所不同。若以原診所變更負責人，其交易性質應屬甲院長出售經營權給乙醫生；若以成立新診所繼續執業，其交易性質應為舊診所出售設備及權利給新診所。
三、相關稅捐問題
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原診所變更負責人：
甲院長個人一時銷售勞務，依目前稽徵實務，營業稅排除對個人非營利性、非經常性之銷售貨物及勞務，故無課徵營業稅問題。應依所得稅法第14條規定，按財產交易所得課徵個人綜合所得稅。財政部971105台財稅字第09704555660號令
一、個人出租自有建物或承租他人建物再出租予第三人，有下列情形之一者，自98年1月1日起，應辦理營業登記，課徵營業稅：
（一）設有固定營業場所（含設置有形之營業場所或設置網站）。
（二）具備「營業牌號」（不論是否已依法辦理登記）。
（三）僱用人員協助處理房屋出租事宜
二、未符合上述情形者，應依所得稅法第14條規定，按租賃所得課徵個人綜合所得稅。 - 成立新診所：
歸類為執行業務者而出售固定資產之案例，該定位為執行業務者個人或其組織之出售，似有疑義；若為診所出售，則需視執行業務成立之組織，是否為營業稅法第6條所定義之營業人。
依營業稅法第1條規定，課徵營業稅並不考慮銷售主體，然仍於營業稅法第2條規定營業人方為銷售貨物及勞務之納稅義務人。
營業稅法第6條「非以營利為目的之事業、機關、團體、組織，有銷售貨物或勞務者。」，其中有銷售貨物或勞務者，是否有經常性或營利性之義，並無明文規定，然觀諸財政部若干解釋令，似乎非其要件。稽徵實務上機關團體偶有銷售貨物或勞務，則以填寫407申報書，向公庫繳納營業稅；而經常性之銷售，則需辦理設籍課稅。
對於銷售其非經常買進、賣出而持有之固定資產，營業稅法第8條第1項22款規定僅有第4章第2節規定計算稅額之營業人，方有免稅規定。而對於非營利及免稅營業人僅有營業稅法第3條之2「不適用視為銷售之規定」，然非經常性之銷售貨物及勞務，則無免稅規定。診所（執行業務者）是否屬於「非以營利為目的之事業、機關、團體、組織者。」，觀諸營業稅法並無定義，僅見所得稅法第11條將「執行業務者」、「營利事業」、「公有事業」、「教育、文化、公益、慈善機關或團體」、「合作社」等各自區別定義。
財政部980606台財稅字第09800142920號函
祭祀公業出售土地容積移轉權益取得之收入屬銷售勞務之收入應課徵營業稅
一、祭祀公業○○○依「文化資產保存法」及「古蹟土地容積移轉辦法」出售土地容積移轉權益與ＸＸ建設公司取得之收入，屬銷售勞務之收入，應依法課徵營業稅。
二、祭祀公業○○○除旨揭勞務收入外，如經查明無其他收入，請輔導該祭祀公業依本部75年9月30日台財稅第7535812號函規定填寫「機關團體銷售貨物或勞務申報銷售額與營業稅額繳款書」向公庫繳納營業稅。財政部851106台財稅第851922210號函
祭祀公業出租不動產之租金收入應課營業稅
祭祀公業所有之房屋、土地出租所取得之租金收入，既屬銷售勞務之收入，自應依法課徵營業稅。
四、延伸討論
財政部為了避免二手車買賣重複課稅，96年增訂營業稅法第15-1條得以設算進項稅額扣抵銷項稅額，然非以營利為目的之事業、機關、團體、組織及專營免稅貨物或勞務之營業人、外國公司無營業行為之辦事處、執行業務者等，其所非經常買進、賣出而持有之固定資產，其進項稅額皆屬尚未扣抵銷項稅額者，而銷售時若無免稅規定，則有重複課稅之虞。
財政部終於於107年5月2日發布解釋令，解決執行業務者銷售非經常買進之固定資產，被無理要求使用407申報書繳納營業稅的問題。
台財稅字第10604704460號
核釋「加值型及非加值型營業稅法」第8條規定，專營專業性勞務之執行業務者，銷售其非經常買進、賣出且專供專業性勞務使用而持有之固定資產，免辦稅籍登記並免徵營業稅。
編按：此專供二字，按賦稅署及【兼營營業人營業稅額計算辦法】裡有關「專供」之用詞，應是相對「兼營」而言，如藥師兼營藥商業務，販售藥品，其固定資產則非屬專供專業性勞務使用（非專供＝兼營）；故未兼營應稅貨物或勞務銷售之執行業務者，其名下所持有之固定資產，如同時作為提供專業性勞務及家庭私用（如執行業務者名下之汽車），而按比例於申報所得稅時認列折舊，應不包括在內（非屬營業稅課徵範圍）。
